Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 AC243960.7-201ENST00000623532 707 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 AL138729.1-201ENST00000406666 664 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 RASSF8-216ENST00000615708 1328 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 CCL11-201ENST00000305869 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 FAM9C-202ENST00000380625 1122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 PTMA-204ENST00000409683 933 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 LINC00458-202ENST00000427299 1030 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 AC096736.3-201ENST00000510753 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 AC090373.1-201ENST00000623955 603 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 LINC02509-201ENST00000508790 691 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 IL22-202ENST00000538666 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms