Protein–RNA interactions for Protein: Q16663

CCL15, C-C motif chemokine 15, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL15Q16663 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL15Q16663 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms