Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FXNQ16595 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FXNQ16595 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
FXNQ16595 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FXNQ16595 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FXNQ16595 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FXNQ16595 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FXNQ16595 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FXNQ16595 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FXNQ16595 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FXNQ16595 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FXNQ16595 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FXNQ16595 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FXNQ16595 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FXNQ16595 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FXNQ16595 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FXNQ16595 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FXNQ16595 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FXNQ16595 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FXNQ16595 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FXNQ16595 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FXNQ16595 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FXNQ16595 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FXNQ16595 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FXNQ16595 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FXNQ16595 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FXNQ16595 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FXNQ16595 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FXNQ16595 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FXNQ16595 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FXNQ16595 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FXNQ16595 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FXNQ16595 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FXNQ16595 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FXNQ16595 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FXNQ16595 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FXNQ16595 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FXNQ16595 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FXNQ16595 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FXNQ16595 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FXNQ16595 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FXNQ16595 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FXNQ16595 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FXNQ16595 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FXNQ16595 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FXNQ16595 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FXNQ16595 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FXNQ16595 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FXNQ16595 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FXNQ16595 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FXNQ16595 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FXNQ16595 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FXNQ16595 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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FXNQ16595 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FXNQ16595 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FXNQ16595 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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FXNQ16595 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FXNQ16595 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FXNQ16595 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FXNQ16595 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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FXNQ16595 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FXNQ16595 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FXNQ16595 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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FXNQ16595 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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FXNQ16595 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FXNQ16595 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FXNQ16595 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FXNQ16595 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FXNQ16595 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FXNQ16595 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FXNQ16595 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FXNQ16595 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FXNQ16595 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FXNQ16595 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FXNQ16595 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FXNQ16595 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FXNQ16595 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FXNQ16595 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FXNQ16595 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FXNQ16595 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FXNQ16595 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FXNQ16595 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FXNQ16595 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FXNQ16595 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FXNQ16595 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FXNQ16595 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FXNQ16595 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FXNQ16595 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FXNQ16595 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
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