Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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SNAPC1Q16533 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
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