Protein–RNA interactions for Protein: Q15772

SPEG, Striated muscle preferentially expressed protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 3,267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEGQ15772 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPEGQ15772 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPEGQ15772 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
SPEGQ15772 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPEGQ15772 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
SPEGQ15772 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPEGQ15772 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPEGQ15772 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPEGQ15772 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPEGQ15772 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPEGQ15772 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SPEGQ15772 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPEGQ15772 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPEGQ15772 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPEGQ15772 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPEGQ15772 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPEGQ15772 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPEGQ15772 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPEGQ15772 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SPEGQ15772 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPEGQ15772 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPEGQ15772 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPEGQ15772 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPEGQ15772 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPEGQ15772 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SPEGQ15772 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPEGQ15772 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPEGQ15772 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPEGQ15772 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPEGQ15772 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPEGQ15772 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPEGQ15772 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPEGQ15772 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SPEGQ15772 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPEGQ15772 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPEGQ15772 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPEGQ15772 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPEGQ15772 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SPEGQ15772 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPEGQ15772 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPEGQ15772 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SPEGQ15772 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPEGQ15772 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPEGQ15772 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SPEGQ15772 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPEGQ15772 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SPEGQ15772 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SPEGQ15772 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SPEGQ15772 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SPEGQ15772 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms