Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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