Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
R3HDM1Q15032 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
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