Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
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