Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms