Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPNMBQ14956 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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