Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NBR1Q14596 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NBR1Q14596 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NBR1Q14596 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBR1Q14596 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBR1Q14596 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBR1Q14596 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBR1Q14596 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBR1Q14596 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBR1Q14596 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBR1Q14596 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBR1Q14596 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBR1Q14596 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NBR1Q14596 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBR1Q14596 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBR1Q14596 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBR1Q14596 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBR1Q14596 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBR1Q14596 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NBR1Q14596 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBR1Q14596 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBR1Q14596 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBR1Q14596 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBR1Q14596 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBR1Q14596 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBR1Q14596 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBR1Q14596 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBR1Q14596 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBR1Q14596 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBR1Q14596 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBR1Q14596 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBR1Q14596 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBR1Q14596 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBR1Q14596 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBR1Q14596 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NBR1Q14596 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBR1Q14596 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBR1Q14596 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBR1Q14596 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBR1Q14596 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBR1Q14596 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBR1Q14596 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBR1Q14596 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBR1Q14596 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBR1Q14596 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBR1Q14596 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBR1Q14596 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBR1Q14596 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBR1Q14596 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBR1Q14596 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBR1Q14596 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBR1Q14596 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBR1Q14596 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBR1Q14596 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBR1Q14596 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBR1Q14596 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBR1Q14596 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBR1Q14596 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBR1Q14596 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBR1Q14596 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBR1Q14596 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBR1Q14596 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBR1Q14596 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBR1Q14596 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBR1Q14596 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NBR1Q14596 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBR1Q14596 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBR1Q14596 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBR1Q14596 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBR1Q14596 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBR1Q14596 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBR1Q14596 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBR1Q14596 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBR1Q14596 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBR1Q14596 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBR1Q14596 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBR1Q14596 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBR1Q14596 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBR1Q14596 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBR1Q14596 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBR1Q14596 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBR1Q14596 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBR1Q14596 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBR1Q14596 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBR1Q14596 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBR1Q14596 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBR1Q14596 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBR1Q14596 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBR1Q14596 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBR1Q14596 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBR1Q14596 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NBR1Q14596 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NBR1Q14596 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NBR1Q14596 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NBR1Q14596 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NBR1Q14596 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NBR1Q14596 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NBR1Q14596 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NBR1Q14596 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NBR1Q14596 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms