Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BECN1Q14457 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
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