Protein–RNA interactions for Protein: Q13972

RASGRF1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF1Q13972 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RASGRF1Q13972 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RASGRF1Q13972 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
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