Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms