Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.05■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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