Protein–RNA interactions for Protein: Q13702

RAPSN, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPSNQ13702 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAPSNQ13702 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
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