Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
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