Protein–RNA interactions for Protein: Q13636

RAB31, Ras-related protein Rab-31, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB31Q13636 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RAB31Q13636 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms