Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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PEX6Q13608 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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PEX6Q13608 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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PEX6Q13608 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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PEX6Q13608 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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PEX6Q13608 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PEX6Q13608 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PEX6Q13608 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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