Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
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