Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
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