Protein–RNA interactions for Protein: Q13349

ITGAD, Integrin alpha-D, humanhuman

Predictions only

Length 1,161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGADQ13349 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGADQ13349 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms