Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms