Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
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