Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.5 ms