Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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FOXF1Q12946 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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FOXF1Q12946 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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FOXF1Q12946 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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FOXF1Q12946 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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FOXF1Q12946 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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FOXF1Q12946 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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FOXF1Q12946 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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