Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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