Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CGNL1Q0VF96 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms