Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms