Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms