Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms