Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF11Q05519 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms