Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms