Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GBE1Q04446 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.1 ms