Protein–RNA interactions for Protein: Q03721

KCNC4, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC4Q03721 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 AL355338.1-201ENST00000612598 913 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms