Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms