Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.2 ms