Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms