Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFAMQ00059 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms