Protein–RNA interactions for Protein: P68104

EEF1A1, Elongation factor 1-alpha 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1A1P68104 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EEF1A1P68104 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms