Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms