Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms