Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FAM3BP58499 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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FAM3BP58499 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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FAM3BP58499 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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FAM3BP58499 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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FAM3BP58499 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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FAM3BP58499 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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FAM3BP58499 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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FAM3BP58499 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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FAM3BP58499 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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FAM3BP58499 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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FAM3BP58499 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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FAM3BP58499 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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FAM3BP58499 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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FAM3BP58499 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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FAM3BP58499 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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FAM3BP58499 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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FAM3BP58499 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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