Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms