Protein–RNA interactions for Protein: P55895

RAG2, V(D)J recombination-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG2P55895 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAG2P55895 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAG2P55895 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAG2P55895 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAG2P55895 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAG2P55895 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAG2P55895 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAG2P55895 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAG2P55895 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAG2P55895 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAG2P55895 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAG2P55895 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAG2P55895 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAG2P55895 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAG2P55895 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAG2P55895 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAG2P55895 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAG2P55895 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAG2P55895 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAG2P55895 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAG2P55895 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAG2P55895 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAG2P55895 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAG2P55895 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAG2P55895 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAG2P55895 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAG2P55895 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAG2P55895 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAG2P55895 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAG2P55895 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAG2P55895 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAG2P55895 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAG2P55895 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAG2P55895 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAG2P55895 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAG2P55895 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAG2P55895 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAG2P55895 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAG2P55895 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAG2P55895 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAG2P55895 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAG2P55895 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAG2P55895 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAG2P55895 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAG2P55895 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAG2P55895 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAG2P55895 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAG2P55895 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAG2P55895 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAG2P55895 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAG2P55895 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAG2P55895 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAG2P55895 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAG2P55895 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAG2P55895 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAG2P55895 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAG2P55895 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAG2P55895 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAG2P55895 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAG2P55895 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAG2P55895 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAG2P55895 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAG2P55895 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAG2P55895 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAG2P55895 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RAG2P55895 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAG2P55895 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAG2P55895 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAG2P55895 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAG2P55895 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAG2P55895 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAG2P55895 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAG2P55895 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAG2P55895 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RAG2P55895 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAG2P55895 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAG2P55895 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAG2P55895 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAG2P55895 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RAG2P55895 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAG2P55895 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RAG2P55895 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAG2P55895 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAG2P55895 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAG2P55895 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAG2P55895 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAG2P55895 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAG2P55895 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAG2P55895 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAG2P55895 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAG2P55895 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAG2P55895 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAG2P55895 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAG2P55895 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAG2P55895 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAG2P55895 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAG2P55895 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAG2P55895 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAG2P55895 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAG2P55895 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms