Protein–RNA interactions for Protein: P55212

CASP6, Caspase-6, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP6P55212 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP6P55212 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP6P55212 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP6P55212 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP6P55212 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP6P55212 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP6P55212 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP6P55212 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP6P55212 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP6P55212 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP6P55212 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP6P55212 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP6P55212 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP6P55212 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP6P55212 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP6P55212 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP6P55212 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP6P55212 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP6P55212 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP6P55212 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP6P55212 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP6P55212 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP6P55212 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP6P55212 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP6P55212 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP6P55212 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP6P55212 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP6P55212 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP6P55212 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP6P55212 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP6P55212 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP6P55212 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP6P55212 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP6P55212 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP6P55212 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP6P55212 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP6P55212 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP6P55212 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP6P55212 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP6P55212 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP6P55212 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP6P55212 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP6P55212 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP6P55212 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP6P55212 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP6P55212 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP6P55212 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP6P55212 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP6P55212 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP6P55212 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP6P55212 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP6P55212 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP6P55212 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP6P55212 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP6P55212 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP6P55212 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP6P55212 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP6P55212 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP6P55212 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP6P55212 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP6P55212 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP6P55212 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP6P55212 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP6P55212 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP6P55212 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP6P55212 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP6P55212 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP6P55212 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP6P55212 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP6P55212 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP6P55212 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP6P55212 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP6P55212 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP6P55212 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP6P55212 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP6P55212 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP6P55212 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP6P55212 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP6P55212 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP6P55212 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP6P55212 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP6P55212 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP6P55212 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP6P55212 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP6P55212 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP6P55212 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP6P55212 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP6P55212 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP6P55212 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP6P55212 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP6P55212 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP6P55212 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP6P55212 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP6P55212 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP6P55212 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP6P55212 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP6P55212 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP6P55212 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP6P55212 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP6P55212 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms