Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms