Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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PGGT1BP53609 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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PGGT1BP53609 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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PGGT1BP53609 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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PGGT1BP53609 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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PGGT1BP53609 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
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PGGT1BP53609 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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PGGT1BP53609 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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PGGT1BP53609 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
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PGGT1BP53609 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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