Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms