Protein–RNA interactions for Protein: P51795

CLCN5, H(+)/Cl(-) exchange transporter 5, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN5P51795 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLCN5P51795 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLCN5P51795 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLCN5P51795 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLCN5P51795 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLCN5P51795 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLCN5P51795 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLCN5P51795 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLCN5P51795 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLCN5P51795 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLCN5P51795 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLCN5P51795 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLCN5P51795 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLCN5P51795 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLCN5P51795 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLCN5P51795 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLCN5P51795 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLCN5P51795 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLCN5P51795 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CLCN5P51795 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CLCN5P51795 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLCN5P51795 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLCN5P51795 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CLCN5P51795 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLCN5P51795 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLCN5P51795 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLCN5P51795 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLCN5P51795 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLCN5P51795 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLCN5P51795 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLCN5P51795 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLCN5P51795 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLCN5P51795 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLCN5P51795 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLCN5P51795 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLCN5P51795 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLCN5P51795 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLCN5P51795 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLCN5P51795 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLCN5P51795 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLCN5P51795 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLCN5P51795 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLCN5P51795 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLCN5P51795 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLCN5P51795 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CLCN5P51795 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLCN5P51795 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLCN5P51795 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLCN5P51795 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLCN5P51795 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLCN5P51795 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CLCN5P51795 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLCN5P51795 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CLCN5P51795 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLCN5P51795 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLCN5P51795 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLCN5P51795 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLCN5P51795 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLCN5P51795 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLCN5P51795 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLCN5P51795 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLCN5P51795 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLCN5P51795 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLCN5P51795 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms